Größtes Highlight einer Pantanal-Reise ist zweifellos die Beobachtung von Jaguaren in freier Wildbahn. Jaguaren nähert man sich am besten vom Boot aus, denn sie halten sich häufig in Ufernähe auf - nicht selten kann man die Katzen bei einem Erfrischungsbad im Fluss ertappen. Die besten Orte, um Jaguare zu sehen, sind der Meeting of the Waters State Park nahe Porto Jofre, sowie das viel seltener besuchte Taiama-Reservat am Paraguay-Fluss.